Überlappende Peptidbibliothek

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Meta-Beschreibung

Benötigen Sie eine überlappende Peptidbibliothek für die Epitopkartierung oder das T--Zell-Screening? Science-Peptide bietet einen professionellen Synthesedienst für überlappende Peptidbibliotheken, der die gesamte Proteinsequenz abdeckt, mit flexibler Peptidlänge und -überlappung und schneller Lieferung in 2–3 Wochen. Nehmen Sie gerne Kontakt mit uns auf.

Überlappende Peptidbibliothek: Schneiden der Proteine, um die Schlüsselsegmente zu finden

Überlappende Peptidbibliothek?
Jeder, der immunologische Forschung betreibt, weiß, dass der direkteste Weg, herauszufinden, wo ein Antikörper an ein Protein bindet oder welchen Abschnitt eine T-Zelle erkennt, darin besteht, das Protein in kleine Stücke zu schneiden und sie einzeln zu probieren.

Bei einer überlappenden Peptidbibliothek handelt es sich um einen kleinen Satz von Teilen -, der auf der Sequenz des Zielproteins basiert. Eine Reihe kurzer überlappender Peptide ist so konzipiert, dass sie das gesamte Protein abdecken. Jedes Peptid teilt eine überlappende Region mit seinen benachbarten Peptiden, wodurch sichergestellt wird, dass kein mögliches Epitop übersehen wird.

Ein Beispiel: Ein Protein mit 300 Aminosäuren, das als 15-Aminosäuren-Peptid konzipiert ist und 11 Aminosäuren überlappt, dann ist das erste Peptid 1-15, das zweite 5-19 und das dritte 9-23 bis zum Ende.

Diese Art von Design ist in der Immunologie üblich:

Antikörper-Epitop-Kartierung: Finden Sie heraus, wo Antikörper tatsächlich binden
T--Zell-Epitop-Screening: um herauszufinden, welche Fragmente von T-Zellen erkannt werden
Impfstoffentwicklung: Screening auf mögliche Epitope, die einen Immunschutz induzieren
Forschung zu Autoimmunerkrankungen: Ziele identifizieren, die sich selbst angreifen

Was wir tun können

1. Peptidbibliotheksdesign: Hilft Ihnen bei der Berechnung der Parameter
Jeder, der überlappende Peptidbibliotheken erstellt hat, weiß, dass die Wahl der Peptidlänge und des Überlappungsgrads die experimentellen Ergebnisse direkt beeinflusst. Wenn das Peptid zu kurz ist, kann das Konformationsepitop fehlen; ist sie zu lang, wird die Synthese schwierig und kostspielig. Wir unterbreiten Ihnen einen konkreten Vorschlag entsprechend Ihrem Forschungszweck:

Parameter	Gemeinsamer Bereich	Im Allgemeinen pushen wir so
Peptidlänge	8-20 Aminosäuren	15mer wird am häufigsten verwendet und bietet ein ausgewogenes Verhältnis zwischen Abdeckung und Syntheseeffizienz
Grad der Überlappung	5-15 Aminosäuren	11 Aminosäuren überlappen sich, sodass keine Auslassungen vorliegen
Abdeckung	die gesamte Länge oder einen bestimmten Bereich	Wenn wir es zum ersten Mal machen, empfehlen wir die volle Länge, aber später können wir es verfeinern
Änderung	Biotin, FITC usw	Fügen Sie so viel hinzu, wie Sie für das Experiment benötigen, sagen Sie es einfach im Voraus

Wir können Sondersituationen bewältigen:

Cystein-reiche Regionen: bilden leicht Disulfidbindungen, können durch Ser oder Ala ersetzt werden
Bei hoher Hydrophobie: schlechte Löslichkeit, etwas Markierung hinzufügen oder Peptidlänge verkürzen
Bekannte nicht{0}funktionale Bereiche: Überspringen Sie sie, sparen Sie Geld und Zeit

2. Synthesekapazität: von einigen Dutzend bis zu einigen Hundert

Projekt	Kapazität
Fluss	Einzelcharge mit 10–500 Peptiden
Peptidlänge	5–30 Aminosäuren (üblicher Bereich für überlappende Peptidbibliotheken)
Reinheit	Roh (70–85 %), normal rein (85–95 %), hochrein (95–98 %).
Einzel-Strip-Ausgabe	0,5 mg bis 100 mg
Form der Lieferung	96-Well-Platten, einzelne Zentrifugenröhrchen, Spritzen
Periodizität	96 Peptide in 2-3 Wochen, große Mengen können in Chargen geliefert werden

3. Qualitätskontrolle: Jedes Peptid wird dokumentiert
Für jedes Peptid in der überlappenden Peptidbibliothek geben wir Folgendes an:

MS-Massenspektrometrie: Molekulargewichte auf einen Blick
HPLC-Reinheit: roh oder gereinigt, die Daten sprechen für sich
COA-Bericht: jeweils ein Peptid, durchsuchbar nach Porenposition oder Sequenz

Möchten Sie mehr tun? Ja:

Messung des Peptidgehalts: Wenn Sie eine genaue Quantifizierung wünschen, tun Sie dies
Löslichkeitstest: Zeigt an, welches Lösungsmittel zum Auflösen verwendet werden soll
Analyse der Aminosäurezusammensetzung: zur Bestätigung des Verhältnisses jeder Aminosäure

Überlappende Peptidbibliothek?

1. Wir machen das schon seit 20 Jahren
Eine überlappende Peptidbibliothek klingt wie „eine Charge Peptid“, aber es gibt noch viele Details, um eine stabile Charge, vollständige Daten und eine pünktliche Lieferung zu erreichen. Im Laufe der Jahre haben wir für unsere Kunden Hunderte von überlappenden Peptidbibliotheksprojekten durchgeführt, die von Dutzenden bis zu Hunderten von Peptiden reichten, und der Prozess lief seit langem reibungslos.

2. Hoher Fluss, auch schnell
Für eine Standardbibliothek mit 96 Peptiden dauert es 2-3 Wochen und für eine Bibliothek mit etwa 200 Peptiden 3–4 Wochen. Wenn das Projekt dringend ist, kann es in Stapel aufgeteilt werden – die Hälfte der Bibliothek kann zuerst genommen werden, um das Experiment zu starten, und der Rest kann nacheinander hinzugefügt werden, ohne zu warten.

3. Reinheit auf Anfrage, ohne Geldverschwendung
Rohöl (70–85 %): Sehen Sie sich beim ersten Screening an, welche Balken zuerst Signale haben, und sparen Sie Geld.
Routine rein (85-95 %): die meisten Zellenexperimente, kostengünstig genug.
Hohe Reinheit (95–98 %): Bei quantitativen oder In-vivo-Experimenten sind die Ergebnisse stabiler.

4. Vollständige Daten, keine Angst vor der Veröffentlichung
Die MS- und HPLC-Daten jedes Peptids werden Ihnen in Excel organisiert zur Verfügung gestellt, sodass Sie genau wissen, welches Peptid welcher Vertiefung entspricht, wie hoch die Reinheit ist und ob das Molekulargewicht korrekt ist oder nicht. Wenn Sie einen Artikel schreiben, können Sie ihn in die Zusatzinformationen einfügen, sodass Sie ihn nicht selbst organisieren müssen.

5. Benötigen Sie einen Modifikator? Das können Sie auch hinzufügen
Einige Experimente erfordern markierte Peptide:
Biotin-Markierung: Streptavidin-Erfassung oder -Erkennung durchführen
FITC-Markierung: zur Fluoreszenzdetektion
Phosphorylierungsmodifikationen: eine Studie zur phosphorylierungsabhängigen Erkennung
Wenn Sie es synthetisieren, können Sie es direkt hinzufügen, sodass Sie es nicht erneut durchführen müssen.

Wo werden überlappende Peptidbibliotheken verwendet?

Forschungsbereiche	Verwendungsmöglichkeiten	Unser empfohlenes Bibliotheksdesign
Antikörper-Epitop-Kartierung	auf der Suche nach einer genauen Lokalisierung der Antikörperbindung	15mer, überlappende 11-12 Aminosäuren
T--Zell-Epitop-Screening	Suchen Sie nach Peptiden, die von T-Zellen erkannt werden	MHC 8-11mer für Klasse I, 15mer für Klasse II
Impfstoffentwicklung	Sieb schützende antigene Epitope	Berichterstattung in voller-Länge
Autoimmunerkrankungen	auf der Suche nach selbst-reaktiven T--Zellzielen	Krankheits-assoziiertes Protein voller-Länge oder spezifischer Regionen
Tumorimmunität	Neoantigen-Screening	Tumormutationsregionen
Proteininteraktionen	Auf der Suche nach verbindlichen Strukturdomänen	Zielbereich, überlappendes Design

Lieferung und Qualitätskontrolle

Lieferform:
Individuelle Abgabe von Zentrifugenröhrchen
Begleitdokumente:
Excel-Übersichtstabelle (Sequenz, MW, Reinheit, MS-Datei-Links für alle Peptide)
Unabhängiger COA für jedes Peptid (PDF)
Zusammenfassender Bericht zum Bibliotheksdesign
Optional: Löslichkeitsdaten, Peptidgehalt, Analyse der Aminosäurezusammensetzung
Bevor jede überlappende Peptidbibliothek versendet wird, prüfen wir, ob die Anzahl der Peptide korrekt und die Daten vollständig sind.

Drei Fälle aus dem echten-Leben

Fall 1: Epitopkartierung in einem Biotechnologieunternehmen

Der Kunde entwickelte einen therapeutischen Antikörper und musste Bindungsepitope identifizieren. Das Zielprotein besteht aus 450 Aminosäuren und wir haben eine überlappende Peptidbibliothek aus 120 Peptiden (15mer, überlappende 11aa) entworfen, die in 2,5 Wochen geliefert wurde. Der Kunde nutzte ELISA zum Screening der Peptidbibliothek und sperrte die Epitopregion innerhalb von drei Tagen, und das Projekt verlief reibungslos.

Fall 2: T--Zell-Screening in einem Forschungsinstitut

Our client studied the T cell response after viral infection and needed an overlapping peptide library covering 300 amino acids of the virus. we synthesized 96 peptides (15mer, overlapping 11aa) with >85% purity. We synthesized 96 peptides (15mer, overlapping 11aa) with >85 % Reinheit, stimulierte PBMC mit diesen Peptiden und identifizierte mehrere immunogene Peptide, die später veröffentlicht wurden.

Fall 3: Tumor-Neoantigene von einem Impfstoffentwicklungsunternehmen

The client identified 20 mutation sites in the patient's tumor samples and needed to synthesize an Overlapping peptide library covering these regions, with a total of ~150 peptides, partially labeled with biotin. We delivered in 4 weeks with >95 % Etikettiereffizienz. Sie verwendeten diese Peptide, um die T--Antworten von Patienten zu untersuchen, und wählten drei neue Antigenkandidaten für die Impfstoffentwicklung aus.

Sprechen Sie über Ihren Bedarf an überlappenden Peptidbibliotheken?

Ob für die Epitopkartierung, das T--Zell-Screening oder die Impfstoffentwicklung, wir können Ihnen beim Entwurf und der Synthese hochwertiger überlappender Peptidbibliotheken helfen.

Du musst mir Folgendes sagen:
Proteinsequenz (oder UniProt ID)
Peptidlänge und -überlappung (wir können Ihnen bei der Gestaltung helfen)
Anzahl der Peptide (ungefährer Bereich)
Reinheitsanforderungen
Modifikationsbedarf (Biotin, FITC, etc.)
Wie viel muss man verlangen (Milligramm pro Peptid)

Geben Sie Ihnen innerhalb von 24 Stunden ein Angebot und einen Lieferplan.